چکیده مقاله
در این مطالعه، توالیهای پروتئینی IFS از شش گونه گیاهی شامل Glycine max ، Trifolium repens ، Trifolium pratense ، Pueraria montana ، Lupinus angustifolios و Pisum sativum از پایگاه داده NCBI استخراج و به فرمت FASTA ذخیره شدند آنالیز پیشبینی سیگنال پپتیدها بر روی این توالی ها با استفاده از نرم افزار SignalP انجام شد تا وجود و موقعیت سیگنال پپتیدها مشخص گردد همچنین، محل هدفگیری و جایگاه زیستی پروتئین ها با بهره گیری از نرمافزار TargetP پیشبینی شد نتایج نشان داد که پروتئینهای IFS دارای سیگنال پپتید در گونه های Trifolium repens ، Glycine max و Lupinus angustifolios عمدتا به کلروپلاست cTP هدایت میشوند، در حالی که پروتئین های Pisum sativum به میتوکندری mTP و پروتئینهای Pueraria montana به مسیرهای ترشحی SP اختصاص دارند در مقابل، پروتئین های IFS گونه Trifolium pratense فاقد سیگنال پپتید بوده و پیش بینی جایگاه زیستی مشخصی برای آنها انجام نشد که نشان دهنده عدم توانایی این پروتئینها در ورود به مسیرهای ترشحی است این تحلیل بیوانفورماتیکی اهمیت سیگنال پپتید در هدفگیری اندامکی و عملکرد پروتئین های IFS را در گونه های مختلف گیاهی تایید میکند
کلیدواژه‌ها
نویسندگان
مریم فرج اوغلی پریخانی
دانشجوی کارشناسی ارشد گیاهان دارویی، دانشکده کشاورزی ومنابع طبیعی، دانشگاه محقق اردبیلی، اردبیل
سکینه پادیاب
دانشجوی دکترای ژنتیک و بهنژادی گیاهی، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه محقق اردبیلی، اردبیل
شیوه ارجاع
فرج اوغلی پریخانی، مریم و پادیاب، سکینه،1404،پیش بینی جایگاه Signal peptide ها بر روی پروتئین هایIFS و محل فعالیت این پروتئینها در سلولهای شش گونه گیاهی با استفاده از نرم افزارهای بیوانفورماتیکی،ششمین کنفرانس بین المللی دستاوردهای خلاقانه معماری، شهرسازی، عمران و محیط زیست در توسعه پایدار خاورمیانه،مشهد
ارائه‌شده در
مجموعه مقالات ششمین کنفرانس بین المللی دستاوردهای خلاقانه معماری، شهرسازی، عمران و محیط زیست در توسعه پایدار خاورمیانه20 اردیبهشت 1404 · مشهد