چکیده مقاله
گیرنده X پرگنن PXR ، که به طور گسترده در بافت های کبدی و رودهای مرتبط با هضم و متابولیسم بیان می شود، مسئول شناسایی و سم زدایی طیف وسیعی از زینوبیوتیک ها است برای درک ماهیت چندلیگاندی این گیرنده و سازوکارهای اتصال آن به لیگاندهای متنوع از رویکردهای محاسباتی از جمله مدل های رابطه کمی ساختار فعالیت QSAR استفاده می شود این روش ها امکان شناسایی سریع ترکیبات بالقوه سمی را فراهم آورده و با کاهش نیاز به آزمون های حیوانی فرایندهای تصمیم گیری نظارتی را تسهیل می کنند اخیرا رویکردی مستقل از بهینه سازی هندسی مولکول که بر توصیف گرهای ساختاری و توپولوژیکی مبتنی است به عنوان یک روش موثر در مدل سازی QSAR معرفی شده است یکی از ویژگی های شاخص این روش استفاده از توصیف گرهای مشتق شده از سیستم ورودی خطی ساده شده مولکولی SMILES است که برای توسعه مدل ها بهره می برد در مطالعه فوق مجموعه ای از ۵۰۰ لیگاند با ساختارهای متنوع برای PXR از مقالات معتبر جمع آوری شد فایل های ورودی نرم افزار از ساختار ترکیبات با نماد SMILES برای نرم افزار CORAL تعریف گشت و داده ها به طور تصادفی به چهار سری شامل آموزش، آموزش نامرئی، کالیبراسیون و مجموعه اعتبارسنجی تقسیم شدند و مدلسازی انجام شد بررسی عملکرد سه مدل نشان داد که شکافت سوم Split نتایج پیش بینی بهتری را برای گیرنده PXR ارائه می دهد، به طوری که مقدار R۲ برابر ۰ ۷۴ به دست آمد قابلیت اتکای مدل های ساخته شده نیز در آزمون Y randomization با مقدار CRp < ۰ ۵ برای هر سه مدل تایید گردید
کلیدواژه‌ها
نویسندگان
حمیده حمزه علی
گروه شیمی واحد تهران شرق دانشگاه آزاد اسلامی، تهران، ایران
شیوه ارجاع
�مزه علی، حمیده،1404،مدل سازی رابطه کمی ساختار ویژگی برای پیش بینی فعال کننده های شناخته شده PXR بر پایه روش بهینه سازی مونت کارلو،هفتمین کنفرانس ملی مهندسی مواد، مهندسی شیمی و ایمنی صنعتی،اسفراین
ارائه‌شده در
مجموعه مقالات هفتمین کنفرانس ملی مهندسی مواد، مهندسی شیمی و ایمنی صنعتی19 آبان 1404 · اسفراین